La Société Francophone du Diabète est dirigée par un Bureau élu par un Conseil d’Administration, qui est composé de plusieurs collèges afin de représenter la diversité des membres de la société. Le Bureau est composé d’un(e) Président(e), d’un(e) Vice-Président(e), d’un(e) Secrétaire Général(e) et d’un(e) Secrétaire Général(e) adjoint(e).
Concernant les Président(e) et Secrétaire Général(e), leur mandat est de deux ans.